José Miguel Carretero Díaz es miembro del equipo de investigaciones de la Sierra de Atapuerca desde el mismo año de su licenciatura en Ciencias Biológicas, en 1986. Completó sus dos años de estudios postdoctorales en la Universidad de California (Berkeley), y ha trabajado en diversos centros de investigación nacionales e internacionales.

Es profesor titular de Paleontología en el Departamento de Ciencias Históricas y Geografía de la Universidad de Burgos y director del Laboratorio de Evolución Humana de dicha Universidad.

Su principal proyecto de investigación, que tiene lugar en los yacimientos arqueo-paleontológicos de la Sierra de Atapuerca, se divide en varias líneas relacionadas con la evolución corporal de los humanos del Pleistoceno Inferior y Medio de la Gran Dolina y la Sima de los Huesos, y los registros arqueológicos del Holoceno del Yacimiento del Portalón.